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作者: 标题: [求助成功]文档拆分 一 （拆分NCBI中fasta格式的文档） 上一主题 | 下一主题 biogene 新手上路 积分 5 发帖 5 注册 2009-5-21 来自 中国 状态 离线 『楼 主』:  [求助成功]文档拆分 一 （拆分NCBI中fasta格式的文档） 在国立生物技术信息中心（NCBI）中的碱基序列下载后，是在一个文件中，文档扩展名为.fasta，很多个序列都在一个文档中，使用起来不是太方便，请大家帮我看看能否用拆分文本文档的方法拆分（扩展名为.fasta，可以用写字板打开）。 要求： 1、将文件从空行处拆分为单个文件 2、将每段中如'>gi|167427515|gb|'后面的字符如''EU289029’'提取出来做为文件名 3、将拆分后文件的扩展名改为.seq 多谢各位大侠了。 文本样式下载地址： http://biogene.ys168.com/?jdfwkey=wwmfl1 文本样式： >gi|167427515|gb|EU289029.1| Newcastle disease virus strain VG/GA clone 5, complete genome ACCAAACAGAGAATCCGTGAGTTACGATAAAAGGCGAAGGAGCAATTGAAGTCGCACGGGTAGAAGGTGT GAATCTCGAGTGCGAGCCCGAAGCACAAACTCGAGGAAGCCTTCTGCCAACATGTCTTCCGTATTCGACG......................... >gi|167424515|gb|EU289029.1| Newcastle disease virus strain VG/GA clone 5, complete genome ACCAAACAGAGAATCCGTGAGTTACGATAAAAGGCGAAGGAGCAATTGAAGTCGCACGGGTAGAAGGTGT GAATCTCGAGTGCGAGCCCGAAGCACAAACTCGAGGAAGCCTTCTGCCAACATGTCTTCCGTATTCGACG......................... >gi|218511471|gb|FJ480823.1| Newcastle disease virus strain Go/CH/HLJ/2/06 fusion protein (F) mRNA, complete cds ATGGGCTCCAGACCTTCTACCAAGAACCCAGCACCTATGATGCTGACTATCCGGGTCGCGCTGGTACTGA GTTGCATCTGTCCGGCAAACTCCATTGATGGCAGGCCTCTTGCAGCTGCAGGAATTGTGGTTACAGGAGA............................. >gi|167427515|gb|EU289029.1| Newcastle disease virus strain VG/GA clone 5, complete genome ACCAAACAGAGAATCCGTGAGTTACGATAAAAGGCGAAGGAGCAATTGAAGTCGCACGGGTAGAAGGTGT GAATCTCGAGTGCGAGCCCGAAGCACAAACTCGAGGAAGCCTTCTGCCAACATGTCTTCCGTATTCGACG......................... [ Last edited by biogene on 2009-5-22 at 23:10 ] 2009-5-23 00:48 yishanju 银牌会员 [b]看你妹啊[/b] 积分 1488 发帖 1357 注册 2006-5-20 状态 离线 『第 2 楼』:   贴 下载地址    此帖被 +1 点积分    点击查看详情    评分人：【 biogene 】 分数： +1  时间：2009-5-23 01:20 有问题请发论坛或者自行搜索,再短消息问我的统统是SB 2009-5-23 00:56 biogene 新手上路 积分 5 发帖 5 注册 2009-5-21 来自 中国 状态 离线 『第 3 楼』:   下载地址已经贴上了，在我的永硕网盘http://biogene.ys168.com/?jdfwkey=wwmfl1  －－－一般文件－－ NCBI文件样式.fasta [ Last edited by biogene on 2009-5-22 at 18:18 ] 2009-5-23 01:14 netbenton 银牌会员 批处理编程迷 积分 1916 发帖 752 注册 2008-12-28 来自 广西 状态 离线 『第 4 楼』:   @echo off&setlocal enabledelayedexpansion for /f "delims=" %%a in (NCBI文件样式.fasta) do (     for /f "tokens=4 delims=|" %%b in ("%%a") do (if "%%b" neq "" set name=%%~nb.seq)     echo %%a>>!name! ) pause    此帖被 +1 点积分    点击查看详情    评分人：【 biogene 】 分数： +1  时间：2009-5-23 05:53 精简 [你的+我的+他的]=>[大家的]    个人网志    2009-5-23 01:39        (37659560)       biogene 新手上路 积分 5 发帖 5 注册 2009-5-21 来自 中国 状态 离线 『第 5 楼』:   很好用，谢谢netbenton的帮助 2009-5-23 06:40

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